Мне кажется, что сначала, нужно решить проблему синхронизации поинтов.

Чтобы доставить поинту сообщение(не важно шифрованное или нет), нужно знать его координаты. Либо нужно расширить схему сети и сделать ее обязаловкой, а так же наконец-то начать использовать адреса -- тогда узнать, где поинт не сложно.

Либо можно придумать скрытоэху, которая синкается всеми. В ней можно устроить e2e шифрование, например с GPG ключами. На ноде хранить сообщения от туда по-минимуму. Но тут нужно развитие клиентов. Чтобы они генерили ключи. Ключи можно синкать по надам в SKS.