vit01> Когда только осваивал org-mode, игрался со вставками кода. Но потом освоил Jupyter Notebook/Lab, влюбился в него и держу мелкие (и не только мелкие) куски кода только там. Можно их и с markdown миксовать вполне

Вообще, zettelkasten намекает, что и org-mode это немного пребор, но это действительно удобный инструмент для структурирования информации. Для вставок кода и ссылок хватило бы и markdown, но org-mode мне просто больше нравится. Плюс это всё таки простая плоская структура текстовых файлов, которую при необходимости можно обрабатывать чем угодно, а какой-нибудь pandoc позволит весьма безболезненно переехать на любой другой подходящий формат.